Ruim 90% van alle belastingvoordelen uit de innovatiebox in Nederland gaat naar slechts drie grote bedrijven: ASML, MSD en Booking. Dit heeft geleid tot zorgen over de steun van gemeenschapsgeld aan een Amerikaanse farmaceut, die miljarden ontvangt, terwijl de kosten voor dure kankermedicijnen de Nederlandse schatkist zwaar belasten. Critici wijzen erop dat deze regeling niet bedoeld was voor zulke ongelijkheden, waarbij de meeste voordelen terechtkomen bij enkele dominante spelers in de markt.