Co-Med is onder vuur komen te liggen na meerdere waarschuwingen van zorgautoriteiten over wanbestuur en het illegaal overnemen van huisartsenpraktijken. De Nederlandse Zorgautoriteit (NZa) heeft geconstateerd dat Co-Med herhaaldelijk de regels heeft overtreden bij de overname van huisartsenpraktijken, wat volgens hen leidt tot ernstige zorgen over de naleving van de zorgfusietoets. Ondanks eerdere signalen van misstanden heeft er geen ingrijpen plaatsgevonden, wat de situatie verder heeft verergerd.