Eiropas Revīzijas palāta ir paudusi būtiskas bažas par "Rail Baltica" projekta īstenošanu, norādot uz strauji augošām izmaksām un neizpildītiem termiņiem. Tiek lēsts, ka projekta pirmā kārta līdz 2030. gadam netiks pabeigta, savukārt izmaksas var sasniegt 23,8 miljardus eiro. Saeimas komisija uzsver, ka trūkst vairāku miljardu eiro, lai pabeigtu pirmo kārtu, un politiķi aplūko, cik līdzekļu nepieciešams pamattrases pabeigšanai. Latvijas Satiksmes ministrija un "RB Rail" cenšas skaidrot situāciju un izvērtēt turpmākas finansēšanas iespējas, tostarp no jaunā ES budžeta. Ir uzsākta kopīga revīzija starp Baltijas valstīm, lai novērtētu projekta lietderību un efektivitāti.